Wesentliche Grundlagen für die Gründung der breecon GmbH wurden im GABI-TILL-Verbund, einem Forschungsverbund der Genomforschung an Pflanzen, geschaffen. Die Gründung des Unternehmens wurde von den Projektleitern des GABI-TILL-Verbundes sowie durch Programme des BMBF und BMWi unterstützt und 2009 realisiert.

Das Gründerteam wird heute wissenschaftlich durch ausgewiesene Experten der Pflanzengenomforschung und wirtschaftlich durch die GO:INcubator GmbH, die UP-Transfer GmbH und den Business Angel Club Berlin-Brandenburg unterstützt. Die breecon GmbH ist Mitglied im Wirtschaftsverbund Pflanzengenomforschung, in dem die führenden Unternehmen der Züchtungsindustrie organisiert sind.

Durch den Standort in Potsdam-Golm ist das Unternehmen in den größten Wissenschaftspark des Landes Brandenburg eingebettet. In Zusammenarbeit mit den ansässigen Instituten der Max-Planck-, Fraunhofer- und Leibniz-Gesellschaften werden die Voraussetzungen zur Entwicklung von innovativen Produkten für die gesunde Ernährung und für die Erzeugung von nachwachsenden Rohstoffen weiter verbessert.