Arabidopsis

Arabidopsis thaliana (Acker-Schmalwand) hat keine Bedeutung für die Landwirtschaft, aber sie wurde seit den 1940er Jahren als Modellpflanze in der Genetik etabliert. Inzwischen ist Arabidopsis die weltweit anerkannteste Modellpflanze für zweikeimblättrige Pflanzen.

 

Zu den Vorteilen der Pflanze gehören ein relativ kleines Genom von 125 Mb und die im Jahr 2000 veröffentlichte Genomsequenz. Das diploide Genom (2n = 10) besteht vorwiegend aus kodierenden DNA-Sequenzen. Sie hat einen kurzen Generationszyklus und sie lässt sich auf relativ kleinem Raum einfach kultivieren.

 

Die Interessen der internationalen Forschergruppen werden durch Organisationen, wie z.B. TAIR (The Arabidopsis Information Ressource) gebündelt. Das Ziel dieser Organisationen ist es, die Entwicklung von A. thaliana als Modellsystem weiter zu fördern sowie den Informationsfluss zu koordinieren. Durch die Entwicklung und Verteilung von genomischen, genetischen und bioinformatischen Ressourcen werden Referenz-Genotypen, BAC-Bibliotheken, genetische Marker, Kartierungspopulationen, T-DNA-Linien und Genom-Sequenz-Datenbanken entwickelt.

 

Die breecon GmbH verfügt derzeit für die Modellpflanze Arabidopsis thaliana über Populationen im Umfang von ca. 10.000 mutagenisierten Linien, davon sind ca. 8.000 Linien vom Ecotyp Col-0. Kleinere Populationen sind von den Ecotypen Ler und C24 verfügbar. Diese Populationen können für die Suche nach neuen funktionellen Genvarianten durchmustert werden. Für die Durchmusterung bietet die breecon GmbH einen TILLING-Service an. Nach Genotypisierung mittels TILLING werden die Samen der identifizierten Genotypen aus der Arabidopsis-Population geliefert.